差額関税制度は、国内の養豚業者を保護するため、１キロ当たり５２４円より単価が安い豚肉に基準輸入価格（約５４６円）との差額を関税として課す制度。
関係者によると、三菱商事は０５年、国内の食肉輸入会社「フーデーン・ジャパン」など２社を介してデンマークの食肉加工会社「ダニッシュ・クラウン」から冷凍豚肉を仕入れた。輸入元はフーデーン社で、関税がほとんどかからないよう１キロ５２０円前後と申告していた。
しかし、東京税関の調査の結果、三菱商事がダニッシュ社から１キロ４００円ほどで購入する約束をしていたことが判明。フーデーン社などの仲介は三菱商事が輸入関税を免れるために行った取引と認定された
